Karle và vợ nghỉ hưu ngày 31 tháng 7 năm 2009, sau khi 2 vợ chồng làm việc tổng cộng 127 năm cho chính phủ Hoa Kỳ (Karle gia nhập Phòng thí nghiệm nghiên cứu Hải quân năm 1944 và vợ 2 năm sau). Vào lúc nghỉ hưu, Karle giữ chức Trưởng ban Khoa học của Phòng thí nghiệm cấu trúc vật liệu. Buổi lễ tiễn biệt hai vợ chồng nghỉ hưu có sự tham dự của Bộ trưởng Hải quân Hoa Kỳ Ray Mabus, người đã trao tặng cặp vợ chồng này "Giải Công vụ Dân chính xuất sắc của Bộ Hải quân" (Department of the Navy Distinguished Civilian Service Award), giải thưởng cao nhất dành cho các công chức dân chính của Hải quân Hoa Kỳ.[4]